how can i store multiple select value using comma in database and retrieve them in php
В принципе, нет.
Это плохая идея хранить что - либо в CSV внутри столбца БД, потому что SQL монументально плох в обработке строк-поэтому добавление, удаление и изменение элементов из строки столбца становится питой.
Вместо этого создайте дополнительную таблицу, которая свяжет ваши "новые значения" со старой таблицей. Например, если бы это была система счетов-фактур, у вас была бы таблица счетов-фактур и таблица линий счетов-фактур:
Счета-фактуры:
ID CustomerID (Foreign key to Customers table) DateIssued DateDue NetTotal VATTotal TotalDue
ID InvoiceID (Foreign key to Invoices table) ProductID (Foreign key to Products table) Quantity UnitCost